MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 plasmid pGEOTH01

Total Repeats: 1856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015665	ACGTT	2	10	31	40	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015665	A	6	6	55	60	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015665	AGAA	2	8	99	106	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015665	A	6	6	105	110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015665	GGC	2	6	111	116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015665	TCAAG	2	10	245	254	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015665	TCAT	2	8	272	279	25 %	50 %	0 %	25 %	336233475
8	NC_015665	TTAT	2	8	309	316	25 %	75 %	0 %	0 %	336233475
9	NC_015665	TGA	2	6	322	327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233475
10	NC_015665	ATCT	2	8	350	357	25 %	50 %	0 %	25 %	336233475
11	NC_015665	ATC	2	6	389	394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233475
12	NC_015665	TAATT	2	10	398	407	40 %	60 %	0 %	0 %	336233475
13	NC_015665	CTC	2	6	410	415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233475
14	NC_015665	TTC	2	6	521	526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233475
15	NC_015665	CATA	2	8	559	566	50 %	25 %	0 %	25 %	336233475
16	NC_015665	TTGTT	2	10	582	591	0 %	80 %	20 %	0 %	336233475
17	NC_015665	TGAT	2	8	623	630	25 %	50 %	25 %	0 %	336233475
18	NC_015665	TGA	2	6	687	692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233475
19	NC_015665	ATG	2	6	704	709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233475
20	NC_015665	GA	3	6	745	750	50 %	0 %	50 %	0 %	336233475
21	NC_015665	TTA	2	6	793	798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233475
22	NC_015665	TCAT	2	8	832	839	25 %	50 %	0 %	25 %	336233475
23	NC_015665	AT	3	6	838	843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015665	AAGT	2	8	861	868	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015665	ATT	2	6	901	906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015665	ACC	2	6	929	934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_015665	TGA	2	6	944	949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015665	T	6	6	1040	1045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015665	TCA	2	6	1091	1096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015665	TCTT	2	8	1126	1133	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015665	GAA	2	6	1177	1182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015665	ATA	2	6	1183	1188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015665	ACA	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015665	CTG	2	6	1309	1314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015665	AAT	2	6	1320	1325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015665	TCT	2	6	1329	1334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015665	AGG	2	6	1464	1469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015665	TGA	2	6	1480	1485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015665	CTG	2	6	1621	1626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015665	T	6	6	1660	1665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015665	T	7	7	1733	1739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015665	T	8	8	1743	1750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015665	A	6	6	1808	1813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015665	TGC	2	6	1838	1843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015665	AC	4	8	1875	1882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015665	ACACA	2	10	1885	1894	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_015665	GAT	2	6	1934	1939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015665	TGT	2	6	2023	2028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233476
49	NC_015665	ATGAA	2	10	2076	2085	60 %	20 %	20 %	0 %	336233476
50	NC_015665	CGG	2	6	2127	2132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233476
51	NC_015665	GCTG	2	8	2187	2194	0 %	25 %	50 %	25 %	336233476
52	NC_015665	A	6	6	2195	2200	100 %	0 %	0 %	0 %	336233476
53	NC_015665	AAG	2	6	2258	2263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233476
54	NC_015665	AGAA	2	8	2303	2310	75 %	0 %	25 %	0 %	336233476
55	NC_015665	A	6	6	2309	2314	100 %	0 %	0 %	0 %	336233476
56	NC_015665	GGC	2	6	2315	2320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233476
57	NC_015665	GC	3	6	2409	2414	0 %	0 %	50 %	50 %	336233476
58	NC_015665	TAT	2	6	2449	2454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233476
59	NC_015665	ATA	2	6	2472	2477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233476
60	NC_015665	GTG	2	6	2488	2493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336233476
61	NC_015665	AAC	2	6	2526	2531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233477
62	NC_015665	T	6	6	2704	2709	0 %	100 %	0 %	0 %	336233477
63	NC_015665	CTT	2	6	2751	2756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233477
64	NC_015665	ACA	2	6	2863	2868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233477
65	NC_015665	CAA	2	6	3201	3206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233477
66	NC_015665	ATGG	2	8	3219	3226	25 %	25 %	50 %	0 %	336233477
67	NC_015665	TGA	3	9	3227	3235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233477
68	NC_015665	CAA	2	6	3252	3257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233477
69	NC_015665	GTA	2	6	3358	3363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233477
70	NC_015665	T	6	6	3448	3453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015665	CAC	2	6	3476	3481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015665	TAC	2	6	3485	3490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015665	TAA	2	6	3521	3526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015665	CATA	2	8	3571	3578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015665	GA	3	6	3606	3611	50 %	0 %	50 %	0 %	336233478
76	NC_015665	GAT	2	6	3646	3651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233478
77	NC_015665	ATG	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233478
78	NC_015665	ATT	2	6	3715	3720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233478
79	NC_015665	ATG	2	6	3752	3757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233478
80	NC_015665	ATA	2	6	3792	3797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233478
81	NC_015665	TCA	2	6	3836	3841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233478
82	NC_015665	TTGA	2	8	3868	3875	25 %	50 %	25 %	0 %	336233478
83	NC_015665	GGC	2	6	3931	3936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233478
84	NC_015665	T	6	6	3964	3969	0 %	100 %	0 %	0 %	336233478
85	NC_015665	AGA	2	6	4029	4034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233478
86	NC_015665	TAG	2	6	4159	4164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233478
87	NC_015665	TC	3	6	4177	4182	0 %	50 %	0 %	50 %	336233478
88	NC_015665	TGC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233478
89	NC_015665	ATGG	2	8	4243	4250	25 %	25 %	50 %	0 %	336233478
90	NC_015665	ATG	2	6	4316	4321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233478
91	NC_015665	CTC	2	6	4364	4369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_015665	T	6	6	4398	4403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015665	TAG	2	6	4551	4556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015665	CTTC	2	8	4565	4572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015665	TGTAA	2	10	4597	4606	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015665	GATA	2	8	4607	4614	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015665	CA	3	6	4662	4667	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015665	TG	3	6	4690	4695	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015665	TTTA	2	8	4720	4727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015665	TTC	2	6	4750	4755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233479
101	NC_015665	T	6	6	4851	4856	0 %	100 %	0 %	0 %	336233479
102	NC_015665	TCGT	2	8	4917	4924	0 %	50 %	25 %	25 %	336233479
103	NC_015665	AGG	2	6	4985	4990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233479
104	NC_015665	TCC	2	6	5114	5119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233479
105	NC_015665	T	6	6	5137	5142	0 %	100 %	0 %	0 %	336233479
106	NC_015665	GAA	2	6	5295	5300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233479
107	NC_015665	CATA	2	8	5309	5316	50 %	25 %	0 %	25 %	336233479
108	NC_015665	TCC	2	6	5329	5334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233479
109	NC_015665	CTT	2	6	5364	5369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233479
110	NC_015665	CTT	2	6	5397	5402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233479
111	NC_015665	CTTC	2	8	5499	5506	0 %	50 %	0 %	50 %	336233479
112	NC_015665	TTG	2	6	5529	5534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233479
113	NC_015665	TGA	2	6	5613	5618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233479
114	NC_015665	TCC	2	6	5624	5629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233479
115	NC_015665	AGCC	2	8	5630	5637	25 %	0 %	25 %	50 %	336233479
116	NC_015665	TAG	2	6	5747	5752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233479
117	NC_015665	TTC	2	6	5806	5811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233479
118	NC_015665	CTT	2	6	5894	5899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233479
119	NC_015665	TAGG	2	8	5907	5914	25 %	25 %	50 %	0 %	336233479
120	NC_015665	TGT	2	6	5935	5940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015665	T	6	6	5966	5971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015665	CAT	2	6	6010	6015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015665	CTG	2	6	6016	6021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015665	CAG	2	6	6028	6033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015665	T	6	6	6034	6039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015665	CCG	2	6	6066	6071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_015665	T	9	9	6083	6091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015665	CAA	2	6	6193	6198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233480
129	NC_015665	GCG	2	6	6207	6212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233480
130	NC_015665	CTT	2	6	6231	6236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233480
131	NC_015665	TTG	2	6	6418	6423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233480
132	NC_015665	AAG	2	6	6430	6435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233480
133	NC_015665	ATT	2	6	6460	6465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233480
134	NC_015665	CGA	2	6	6469	6474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233480
135	NC_015665	TCAT	2	8	6541	6548	25 %	50 %	0 %	25 %	336233480
136	NC_015665	AGCA	2	8	6602	6609	50 %	0 %	25 %	25 %	336233480
137	NC_015665	TGT	2	6	6644	6649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233480
138	NC_015665	GTTTT	2	10	6657	6666	0 %	80 %	20 %	0 %	336233480
139	NC_015665	AAC	2	6	6697	6702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233480
140	NC_015665	A	6	6	6832	6837	100 %	0 %	0 %	0 %	336233480
141	NC_015665	TGA	2	6	6884	6889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233480
142	NC_015665	AAGCAA	2	12	6916	6927	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	336233480
143	NC_015665	CGC	2	6	6937	6942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233480
144	NC_015665	GCA	2	6	6968	6973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233480
145	NC_015665	TAAC	2	8	6997	7004	50 %	25 %	0 %	25 %	336233480
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148	NC_015665	TCT	2	6	7283	7288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233480
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153	NC_015665	A	6	6	7381	7386	100 %	0 %	0 %	0 %	336233480
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177	NC_015665	GAAACA	2	12	8384	8395	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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179	NC_015665	CGG	2	6	8440	8445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_015665	T	6	6	8469	8474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_015665	AATG	2	8	8502	8509	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_015665	CAT	2	6	8643	8648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_015665	TGC	2	6	8706	8711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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186	NC_015665	CTT	2	6	8894	8899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_015665	TTATT	2	10	9122	9131	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_015665	T	6	6	9157	9162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_015665	TTGT	2	8	9232	9239	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
191	NC_015665	GCA	2	6	9273	9278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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257	NC_015665	T	6	6	11498	11503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_015665	A	6	6	11528	11533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_015665	TAA	2	6	11540	11545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_015665	TTCA	2	8	11632	11639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
263	NC_015665	ACG	2	6	11930	11935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_015665	AAAAG	2	10	11971	11980	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
265	NC_015665	GCG	2	6	12021	12026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_015665	CCTG	2	8	12052	12059	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
267	NC_015665	CTG	2	6	12062	12067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_015665	AAGC	2	8	12137	12144	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
269	NC_015665	CAT	2	6	12164	12169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_015665	GTG	2	6	12217	12222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
271	NC_015665	C	6	6	12265	12270	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
272	NC_015665	TTGC	2	8	12274	12281	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
273	NC_015665	AGC	2	6	12357	12362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_015665	CGC	2	6	12404	12409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
275	NC_015665	AAC	2	6	12463	12468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_015665	A	7	7	12514	12520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_015665	AAG	2	6	12531	12536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_015665	T	6	6	12551	12556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_015665	CGG	2	6	12563	12568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_015665	AAT	2	6	12621	12626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_015665	TCA	2	6	12648	12653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_015665	CATG	2	8	12657	12664	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
283	NC_015665	CCA	2	6	12697	12702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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408	NC_015665	A	6	6	18681	18686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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410	NC_015665	AAG	2	6	18851	18856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_015665	T	7	7	18964	18970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NC_015665	TTAC	2	8	18975	18982	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
414	NC_015665	A	6	6	19041	19046	100 %	0 %	0 %	0 %	336233487
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